首 頁 自治區(qū)科研團(tuán)隊構(gòu)建完成發(fā)育時空調(diào)控數(shù)據(jù)庫
2022年10月，內(nèi)蒙古大學(xué)教授左永春團(tuán)隊在哺乳動物早期胚胎發(fā)育的生物信息學(xué)研究領(lǐng)域取得重要科研進(jìn)展，相關(guān)成果以“EmAtlas：探索哺乳動物胚胎發(fā)生時空激活的綜合地圖集”為題，發(fā)表于國際著名出版集團(tuán)牛津大學(xué)出版社旗下學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》。
科研團(tuán)隊利用生物信息學(xué)和計算生物學(xué)方法創(chuàng)建完成包含64TB的胚胎發(fā)育多組學(xué)時空調(diào)控圖譜數(shù)據(jù)庫與分析云平臺EmAtlas。左永春介紹，科研團(tuán)隊利用Nextflow（并行多組學(xué)自動化分析管理系統(tǒng)），完成基于12種前沿測序技術(shù)產(chǎn)生的821個數(shù)據(jù)集，共涉及人、小鼠等物種的9113個樣本的生物信息學(xué)挖掘。隨后將這些數(shù)據(jù)根據(jù)植入前胚胎、胎兒、新生兒的時空發(fā)育順序進(jìn)行歸檔整理，共包含65個不同發(fā)育時間點(diǎn)的組織類型和116種細(xì)胞類型。此外，23個國內(nèi)外權(quán)威功能知識庫的發(fā)育相關(guān)注釋也被人工審編并整合到該數(shù)據(jù)庫。圍繞哺乳動物胚胎生長發(fā)育的全鏈條，該數(shù)據(jù)庫還可實(shí)現(xiàn)從胚胎發(fā)育的兩個尺度（時序、空間），宏觀到微觀的五個維度（組織、細(xì)胞、基因組、基因、蛋白質(zhì)）解析哺乳動物早期發(fā)育進(jìn)程。
據(jù)悉，該數(shù)據(jù)庫的建成，將為從事哺乳動物發(fā)育領(lǐng)域的研究人員和臨床醫(yī)師提供有力的分析手段，并為人類新生兒遺傳疾病、干細(xì)胞醫(yī)療、輔助生殖等優(yōu)生優(yōu)育手段提供專業(yè)的大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)分析服務(wù)，也為優(yōu)良家畜保種育種等繁育工作提供新的研究思路。
當(dāng)前位置：
